就在教宗本笃十六世到达马德里之前几个小时，来西班牙参加世界青年大会的部分成员和教宗的反对者起了冲突，叫骂互殴不断。警方赶来驱散两方人马。但是场面太激列，警力无法控制，一群极端分子甚至用酒瓶丢向警察。警察后来用警棍来驱赶这些人。最后有8人被逮捕，11人受伤。
西班牙"国家报"星期4出版的报纸写道："在教宗到达之前发生这种事，实在不应该。这样的行为让这个城市蒙上阴影"。一个月以后，本笃十六世将访问他的家乡德国。从9月22日到25日，他将访问柏林、图林根和弗赖堡。他人还没到德国，一个位于柏林的反教宗组织已经表示到时会举行示威抗议活动。
在马德里，一些左翼分子、同性恋者和教宗反对者共同组成了游行队伍。当队伍来到太阳门广场时，和教宗的拥护者起了冲突。太阳门广场向来被抗议示威者视为是抗议的圣地。游行队伍呼喊着"去做弥撒吧！"或是"教宗是纳粹！"的口号走向朝圣者的队伍。这些来朝圣的教宗支持者则回应对方高喊："本笃教宗万岁！"
反对者振振有词，他们认为天主教世界青年大会的举行和教宗的到访，大费周章，特别是在经济危机的情况下还花费纳税人这么多钱。这些人指着桌上的背包，对着参加世界青年大会的年轻人说："你们的背包是用我们纳税人的钱买的。"每一个参加世界青年大会的人都可以获得这样一个背包。
反对者的游行抗议计划早在青年大会开始之前就在西班牙引起争论。政府原先反对游行队伍经过太阳门广场，因为警方担心会在那里会引起纠纷，但是政府最后还是做出了让步。双方在对峙时，大部分的时间只是互相叫骂。一群来自澳大利亚的女学生，她们因为听不懂西班牙文，夹在人群中不清楚到底发生什么事。
警方赶来驱逐群众
每一次教宗出访时都会引起反对者的质疑，认为花费太多纳税人的钱。就像本笃十六世去年访问英国时。梵蒂冈发言人隆巴迪（Federico Lombardi ）已经习惯面对反教宗或是反教会的示威抗议。在教宗启程到马德里前，他就对已经预告的示威抗议活动不以为然的说："在教宗出国访问时一直都会有示威抗议。"
九个月前，教宗本笃十六世首先拜访亚哥大教堂(santiago de compostela)，而后访问巴塞罗那，在那里他严厉批判西班牙的世俗主义。西班牙左派政府允许同性恋婚姻的法律和让人工流产手术变得比较简便的措施，导致马德里和天主教的关系变紧张。
